Thuế khi giải thể công ty: quy trình quyết toán và thủ tục mới nhất 2026

Dịch vụ giải thể Dịch vụ kế toán thuế Tin tức doanh nghiệp Tin tức sự kiện
28/01/2026
Share: Facebook Twitter Linkedin

Quyết toán thuế khi giải thể công ty

Việc hoàn tất nghĩa vụ thuế khi giải thể công ty là bước bắt buộc và phức tạp nhất để một doanh nghiệp có thể rút lui khỏi thị trường một cách hợp pháp. Hiểu rõ quy trình này không chỉ giúp chủ doanh nghiệp tránh được các khoản phạt hành chính nặng nề mà còn đảm bảo quyền lợi pháp lý về lâu dài.

 

1. Thuế khi giải thể công ty là gì và tại sao phải quyết toán?

Nhiều chủ doanh nghiệp lầm tưởng rằng chỉ cần nộp thông báo dừng hoạt động lên Sở Kế hoạch và Đầu tư là xong. Tuy nhiên, trên thực tế, linh hồn của quá trình này nằm ở việc xử lý nghĩa vụ thuế khi giải thể công ty.

Quyết toán thuế giải thể là quá trình cơ quan thuế kiểm tra, rà soát toàn bộ hồ sơ, chứng từ, sổ sách kế toán của doanh nghiệp kể từ kỳ quyết toán gần nhất cho đến thời điểm có quyết định giải thể. Mục đích là để xác định xem doanh nghiệp đã nộp đúng, nộp đủ các loại thuế vào Ngân sách Nhà nước hay chưa.

Các loại thuế cốt lõi mà doanh nghiệp phải đối mặt bao gồm:

  • Thuế Giá trị gia tăng (VAT): Xử lý số thuế còn được khấu trừ hoặc số thuế phải nộp đối với hàng hóa, tài sản thanh lý.
  • Thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN): Quyết toán trên phần lợi nhuận phát sinh trong kỳ tính thuế cuối cùng.
  • Thuế Thu nhập cá nhân (TNCN): Quyết toán cho người lao động đến thời điểm chấm dứt hợp đồng.
  • Thuế Môn bài: Phải hoàn thành nghĩa vụ của năm hiện tại. Mặc dù từ 2026, theo Nghị quyết 198/2025/QH15, lệ phí môn bài bị bãi bỏ. Tuy nhiên, đối với những công ty chưa hoàn thành nghĩa vụ thuế môn bài năm 2025, cần nhanh chóng hoàn thành trước ngày 1/1/2026.

 

>>> Xem thêm: Từ 2026, có cần kê khai và nộp lệ phí môn bài không?

Việc bỏ qua bước này sẽ khiến mã số thuế của doanh nghiệp bị treo vĩnh viễn trên hệ thống, người đại diện pháp luật có thể bị “cấm xuất cảnh” hoặc gặp khó khăn khi thành lập doanh nghiệp mới trong tương lai.

 

2. Thứ tự ưu tiên thanh toán các khoản nợ khi giải thể doanh nghiệp

Khi thực hiện các nghĩa vụ về thuế khi giải thể công ty, doanh nghiệp cần tuân thủ nghiêm ngặt trình tự thanh toán các khoản nợ theo quy định tại Điều 208 Luật Doanh nghiệp 2020. Việc hiểu sai thứ tự ưu tiên có thể dẫn đến các tranh chấp dân sự hoặc khiếu nại từ phía người lao động và chủ nợ.

Thứ tự ưu tiên cụ thể như sau:

STT ưu tiên Các khoản nợ Cụ thể
 1 Nợ lương và quyền lợi lao động
Bao gồm lương thực tế, trợ cấp thôi việc, Bảo hiểm xã hội, Bảo hiểm y tế, Bảo hiểm thất nghiệp và các quyền lợi khác theo thỏa ước lao động tập thể.
2 Nợ thuế
Đây là nghĩa vụ tài chính quan trọng nhất đối với Nhà nước. Doanh nghiệp không thể hoàn tất thủ tục tại Sở Tài chính nếu chưa có văn bản xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế khi giải thể công ty từ cơ quan thuế quản lý trực tiếp.
3 Các khoản nợ khác
Bao gồm nợ nhà cung cấp, nợ vay ngân hàng, nợ cá nhân và các hợp đồng kinh tế đang dang dở.

Sau khi đã thanh toán hết các khoản nợ trên và chi phí giải thể, phần tài sản còn lại mới được chia cho các thành viên, cổ đông theo tỷ lệ góp vốn.

 

3. Hồ sơ quyết toán thuế khi giải thể công ty cần những gì?

Sau khi nộp hồ sơ thông báo giải thể đến Sở Tài chính, doanh nghiệp cần chuẩn bị các hồ sơ sau để hoàn tất thủ tục thuế khi giải thể công ty

3.1 Hồ sơ xin đóng mã số thuế (MST)

Hồ sơ này được gửi đến cơ quan trực tiếp quản lý thuế của doanh nghiệp. Cụ thể giấy tờ trong hồ sơ cần có gồm:

– Mẫu đề nghị xin chấm dứt hiệu lực MST công ty.

– Biên bản họp kèm quyết định theo từng loại hình công ty gồm: 

  • Hội đồng thành viên (Công ty hợp danh, công ty TNHH từ 2 thành viên).
  • Đại hội đồng cổ đông (Đối với loại hình cần giải thể là công cổ phần  ).
  • Chủ sở hữu công ty (đối với Đối với loại hình cần giải thể là công ty TNHH 1 thành viên).
  • Chủ công ty (Đối với loại hình cần giải thể là doanh nghiệp tư nhân).

– Một số trường hợp, cơ quan thuế sẽ yêu cầu doanh nghiệp nộp thêm các công văn sau:

  • Cam kết của doanh nghiệp về việc không phát sinh doanh thu.
  • Cam kết của doanh nghiệp về việc không xin hoàn lại bất cứ khoản thuế nào được nộp thừa.
  • Cam kết của doanh nghiệp về việc không nợ thuế hải quan hay hoạt động xuất nhập khẩu.
  • Cam kết về việc doanh nghiệp không có tài sản thanh lý.

 

Lưu ý: Hiện nay, hệ thống của Sở Tài Chính cùng hệ thống cơ quan thuế đã có sự liên kết với nhau. Vì vậy, nếu trước đó doanh nghiệp đã gửi thông báo giải thể (lần 1) tới Sở Tài Chính và được cơ quan chức năng này xét duyệt, cập nhật trạng thái “NTT đang làm thủ tục giải thể” thì cơ quan thuế cũng sẽ nắm được thông tin này. Do đó, doanh nghiệp không cần nộp đề nghị chấm dứt MST mà chỉ cần nộp hồ sơ báo cáo cùng với hồ sơ quyết toán thuế theo quy định.

 

3.2 Hồ sơ thực hiện quyết toán thuế khi giải thể công ty

Thường thì hồ sơ quyết toán thuế thường được doanh nghiệp nộp vào cuối năm. Nhưng khi tiến hành giải thể thì doanh nghiệp cần nộp hồ sơ từ đầu năm tính đến thời hạn giải thể công ty. Theo đó, hồ sơ quyết toán thuế khi giải thể công ty sẽ cần chuẩn bị 2 bộ gồm:

3.2.1 Hồ sơ quyết toán thuế TNDN khi tiến hành giải thể công ty

– Tờ khai về quyết toán thuế TNDN.

– BCTC năm hoặc đến thời điểm giải thể.

– Các giấy tờ khác tùy theo thực tế phát sinh trong hoạt động của doanh nghiệp:

  • Phụ lục về kết quả của hoạt động kinh doanh, sản xuất.
  • Phụ lục chuyển lỗ.
  • Các phụ lục liên quan tới ưu đãi thuế TNDN.
  • Phụ lục về thuế TNDN mà công ty đã nộp ở nước ngoài đã được trừ ở kỳ tính thuế.
  • Phụ lục về thuế TNDN  liên quan tới những hoạt động chuyển nhượng bất động sản.
  • Các phụ lục báo cáo về việc trích hay sử dụng quỹ khoa học – công nghệ (nếu có).
  • Phụ lục thông tin liên quan tới các giao dịch điện tử (nếu có).
  • Phụ lục bảng phân bố tiền thuế TNDN công ty phải nộp (áp dụng cho cơ sở sản xuất).

– Đối với công ty có dự án đầu tư ở nước ngoài thì hồ sơ quyết toán thuế TNDN khi giải thể cần có thêm:

  • Tờ khai thuế TNDN ở nước ngoài kèm xác nhận của người đóng thuế (bản chụp).
  • Xác nhận số thuế đã nộp của cơ quan thuế ở nước ngoài (bản gốc) hoặc chứng từ nộp thuế ở nước ngoài kèm xác nhận của người đóng thuế (bản chụp).

 

3.2.2 Hồ sơ quyết toán thuế TNCN khi giải thể công ty

Đây là hồ sơ thuế khi giải thể công ty cần phải chuẩn bị với các doanh nghiệp trả thu nhập chịu thuế cho người lao động từ tiền công, tiền lương. Cụ thể hồ sơ gồm:

  • Tờ khai quyết toán thuế TNCN.
  • Phụ lục bảng kê cụ thể những cá nhân thuộc diện tính thuế TNCN dựa theo biểu lũy tiến từng phần.
  • Phụ lục bảng kê cụ thể những cá nhân thuộc diện tính thuế TNCN dựa theo thuế suất toàn phần.
  • Phụ lục bảng kê cụ thể người phụ thuộc được giảm trừ gia cảnh.
  • Giấy ủy quyền làm thủ tục quyết toán thuế TNCN của người lao động ủy quyền cho doanh nghiệp thực hiện quyết toán.
  • Giấy ủy quyền thực hiện thủ tục nếu người đại diện pháp lý công ty không trực tiếp nộp hồ sơ.

 

4. Quy trình 6 bước xử lý thuế để đóng mã số thuế doanh nghiệp

Thực hiện quy trình thuế khi giải thể công ty đòi hỏi sự kiên nhẫn và sự phối hợp chặt chẽ giữa kế toán doanh nghiệp và cán bộ thuế.

Bước 1: Chuẩn bị hồ sơ và quyết toán các khoản thuế phát sinh Doanh nghiệp kiểm kê toàn bộ hóa đơn, thực hiện thủ tục hủy hóa đơn tồn đọng. Kê khai đầy đủ thuế VAT, TNDN và TNCN phát sinh đến thời điểm có quyết định giải thể.
Bước 2: Nộp hồ sơ quyết toán thuế điện tử
Kế toán nộp tờ khai quyết toán thuế TNDN (Mẫu 03/TNDN), quyết toán thuế TNCN và Báo cáo tài chính chốt đến ngày giải thể lên hệ thống của Tổng cục Thuế.
Bước 3: Hoàn thành nghĩa vụ thanh toán nợ thuế Doanh nghiệp phải nộp toàn bộ tiền thuế còn nợ, tiền chậm nộp vào Ngân sách Nhà nước. Đây là bước “chặn” kỹ thuật; nếu còn nợ thuế, hệ thống sẽ không cho phép thực hiện các bước tiếp theo tại Sở Tài chính.
Bước 4: Đối soát và kiểm tra quyết toán tại trụ sở
Cơ quan thuế quản lý sẽ tiến hành kiểm tra hồ sơ. Doanh nghiệp cần giải trình các khoản chi phí và nhận biên bản kiểm tra. Nếu có sai phạm, doanh nghiệp nộp phạt để nhận Giấy xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế.
Bước 5: Nộp hồ sơ giải thể và đóng mã số thuế tại Sở Tài chính Sau khi có xác nhận từ cơ quan thuế, doanh nghiệp nộp hồ sơ giải thể (bao gồm thông báo giải thể, biên bản họp, quyết định giải thể) lên Phòng Đăng ký kinh doanh thuộc Sở Tài chính. Tại đây, cán bộ sẽ kiểm tra tính hợp lệ và thực hiện xóa tên doanh nghiệp trên hệ thống thông tin quốc gia.
Bước 6: Lưu trữ hồ sơ hậu giải thể Mặc dù doanh nghiệp đã chấm dứt sự tồn tại pháp lý tại Sở Tài chính, toàn bộ chứng từ kế toán, sổ sách thuế vẫn phải được lưu trữ trong 10 năm theo quy định để phục vụ các đợt thanh tra, đối soát từ các cơ quan chức năng khi có yêu cầu.

 

5. Các lưu ý “vàng” giúp doanh nghiệp quyết toán thuế suôn sẻ

Kinh nghiệm xử lý thuế khi giải thể công ty cho thấy, có những chi tiết nhỏ nhưng nếu không lưu ý sẽ gây hậu quả lớn:

1 Đừng đóng tài khoản ngân hàng quá sớm Nhiều doanh nghiệp đóng tài khoản ngay khi có quyết định giải thể. Điều này khiến việc nộp các khoản thuế cuối cùng hoặc nhận tiền hoàn thuế (nếu có) trở nên cực kỳ khó khăn. Hãy chỉ đóng tài khoản sau khi đã nhận được thông báo đóng mã số thuế từ cơ quan thuế.
2 Nghĩa vụ lưu trữ hồ sơ 10 năm
Dù công ty đã bị xóa tên trên sổ đăng ký kinh doanh, nhưng theo Luật Kế toán, hồ sơ chứng từ vẫn phải được lưu trữ trong 10 năm. Cơ quan chức năng vẫn có quyền truy cứu trách nhiệm cá nhân nếu sau này phát hiện có dấu hiệu gian lận thuế nghiêm trọng.
3 Kiểm tra kỹ hóa đơn đầu vào Trước khi quyết toán thuế khi giải thể công ty, hãy rà soát xem có hóa đơn nào từ các “doanh nghiệp bỏ trốn” hay không. Việc chủ động điều chỉnh giảm khấu trừ trước khi cơ quan thuế kiểm tra sẽ giúp bạn tránh được án phạt trốn thuế.
4 Duy trì chữ ký số (Token)
Đừng vội hủy hợp đồng chữ ký số. Bạn sẽ cần nó để ký các tờ khai cuối cùng hoặc phản hồi các thông báo điện tử từ cơ quan thuế trong suốt quá trình giải thể.

 

Lưu ý: Giải quyết nghĩa vụ thuế khi giải thể công ty chỉ là 1 trong 3 bước để chấm dứt hoạt động của doanh nghiệp. Nếu bạn muốn giải thể công ty, bạn có thể tham khảo thêm bài viết sau để biết thêm chi tiết: Quy trình giải thể công ty chi tiết

 

6. Dịch vụ giải thể công ty giá rẻ tại Việt Mỹ Law

Nếu bạn cảm thấy quy trình xử lý thuế khi giải thể công ty quá rắc rối và mất thời gian, hãy để Việt Mỹ Law đồng hành cùng bạn. Chúng tôi hiểu rằng chủ doanh nghiệp cần dành thời gian cho những dự định kinh doanh mới thay vì sa lầy vào những đống hồ sơ thuế cũ.

Tại sao nên chọn Việt Mỹ Law?

14 năm kinh nghiệm Thành lập từ 2012, Việt Mỹ Law tự hào khi đem lại giải pháp pháp lý và kế toán thuế tối ưu, đã và đang đồng hành cùng 5000+ doanh nghiệp. Quy trình dịch vụ sau 14 năm hoạt động được tinh chỉnh hoàn thiện, đảm bảo thủ tục giải thể của công ty quý khách ĐÚNG – NHANH – TIẾT KIỆM.
Bộ phận kế toán và luật phối hợp ăn ý Một trong những điều khiến Việt Mỹ Law tự tin là đơn vị cung cấp dịch vụ pháp lý và kế toán thuế doanh nghiệp hàng đầu Việt Nam, đó chính là chúng tôi đồng thời sở hữu 2 đội ngũ luật sư, chuyên viên pháp lý và kế toán dày dặn kinh nghiệm. Việt Mỹ Law am hiểu sâu sắc cách làm việc với từng cơ quan thuế địa phương, giải quyết được tất cả các thủ tục pháp lý và thuế liên quan phức tạp.
Tối ưu hóa số thuế phải nộp Chúng tôi tư vấn rà soát sổ sách trước khi nộp hồ sơ, giúp doanh nghiệp cân đối chi phí hợp lý, hợp lệ để giảm thiểu số thuế truy thu và tiền phạt.
Dịch vụ trọn gói – Giá rẻ Chỉ từ 1.500.000 VNĐ cho các trường hợp doanh nghiệp không phát sinh doanh thu. Đối với doanh nghiệp có hoạt động, chúng tôi báo giá minh bạch, cam kết không phát sinh chi phí “ngầm”.
Tốc độ Rút ngắn thời gian chờ đợi đóng mã số thuế nhờ quy trình xử lý hồ sơ khoa học và mối quan hệ tốt với cơ quan ban ngành.
Bảo mật Cam kết bảo mật tuyệt đối thông tin tài chính của khách hàng ngay cả khi đã hoàn tất hợp đồng.

 

>>> Tham khảo thêm: 

 

7. Câu hỏi thường gặp (FAQs)

1. Công ty thành lập lâu rồi nhưng không hoạt động, không có hóa đơn thì có phải quyết toán thuế khi giải thể công ty không? 

. Theo quy định, dù không có doanh thu phát sinh, doanh nghiệp vẫn phải nộp tờ khai quyết toán thuế TNDN, TNCN và báo cáo tài chính trắng cho đến thời điểm giải thể để cơ quan thuế có căn cứ đóng mã số thuế.

2. Thời gian chờ đợi hoàn thành nghĩa vụ thuế thường mất bao lâu? 

Theo luật, cơ quan thuế có 45 ngày để phản hồi. Tuy nhiên, thời gian thực tế phụ thuộc vào việc sổ sách của doanh nghiệp có sạch hay không. Nếu thuê dịch vụ chuyên nghiệp, thời gian có thể rút ngắn xuống còn 20-30 ngày.

3. Nếu đang nợ thuế có giải thể được không? 

Không. Nghĩa vụ thuế khi giải thể công ty phải được hoàn thành 100%. Nếu không đủ khả năng tài chính nộp thuế, doanh nghiệp có thể phải chuyển sang thủ tục phá sản.

4. Tôi có thể tự thực hiện thủ tục thuế khi giải thể công ty không? 

Bạn hoàn toàn có thể tự làm nếu am hiểu về kế toán thuế. Tuy nhiên, đa số các chủ doanh nghiệp gặp khó khăn ở bước giải trình số liệu dẫn đến bị phạt hành chính vì sai sót mẫu biểu hoặc thiếu chứng từ.

 

Tạm kết

Xử lý thuế khi giải thể công ty là một hành trình cần sự tỉ mỉ và kiến thức pháp luật vững chắc. Hy vọng bài viết này đã cung cấp cái nhìn tổng quan nhất để bạn có thể lên kế hoạch cho doanh nghiệp của mình.

Hãy Liên hệ với chúng tôi ngay để được tư vấn miễn phí 24/7.

Giải pháp luật doanh nghiệp tối ưu, đồng hành cùng bạn

Việt Mỹ Law cung cấp dịch vụ pháp lý, tư vấn luật, thành lập doanh nghiệp, giấy phép kinh doanh và hỗ trợ pháp luật trọn gói. Uy tín – Nhanh chóng – Đúng luật.

HOTLINE: 0989 699 287 (HỖ TRỢ 24/7)